MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.02

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019685	ACCGC	2	10	559	568	20 %	0 %	20 %	60 %	427726361
2	NC_019685	CTT	2	6	603	608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726361
3	NC_019685	CGCC	2	8	614	621	0 %	0 %	25 %	75 %	427726361
4	NC_019685	GGGA	2	8	719	726	25 %	0 %	75 %	0 %	427726361
5	NC_019685	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726361
6	NC_019685	ATC	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726361
7	NC_019685	TGA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726361
8	NC_019685	TC	3	6	1103	1108	0 %	50 %	0 %	50 %	427726361
9	NC_019685	TTC	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726361
10	NC_019685	CTTT	2	8	1139	1146	0 %	75 %	0 %	25 %	427726361
11	NC_019685	TCC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427726361
12	NC_019685	CAG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726361
13	NC_019685	CAC	2	6	1245	1250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726361
14	NC_019685	GGC	2	6	1251	1256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726361
15	NC_019685	CAGCGT	2	12	1290	1301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427726361
16	NC_019685	TCACC	2	10	1311	1320	20 %	20 %	0 %	60 %	427726361
17	NC_019685	AAGC	2	8	1332	1339	50 %	0 %	25 %	25 %	427726361
18	NC_019685	CAGA	2	8	1398	1405	50 %	0 %	25 %	25 %	427726361
19	NC_019685	TGA	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726361
20	NC_019685	CGG	2	6	1455	1460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726361
21	NC_019685	CAC	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726361
22	NC_019685	GAC	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726361
23	NC_019685	CGG	3	9	1795	1803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726362
24	NC_019685	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726362
25	NC_019685	CTT	2	6	1896	1901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726363
26	NC_019685	CGA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726364
27	NC_019685	TTC	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726364
28	NC_019685	CAGCC	2	10	2126	2135	20 %	0 %	20 %	60 %	427726364
29	NC_019685	ATT	3	9	2142	2150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726364
30	NC_019685	AAT	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726364
31	NC_019685	TGC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726364
32	NC_019685	TCA	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726365
33	NC_019685	A	6	6	2347	2352	100 %	0 %	0 %	0 %	427726365
34	NC_019685	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	427726365
35	NC_019685	CA	3	6	2493	2498	50 %	0 %	0 %	50 %	427726365
36	NC_019685	ACG	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726365
37	NC_019685	T	6	6	2591	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	427726365
38	NC_019685	TTG	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726365
39	NC_019685	CCAA	2	8	2776	2783	50 %	0 %	0 %	50 %	427726366
40	NC_019685	AGGA	2	8	2849	2856	50 %	0 %	50 %	0 %	427726366
41	NC_019685	GTT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726366
42	NC_019685	AAG	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726366
43	NC_019685	GCA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726366
44	NC_019685	AGAC	2	8	2963	2970	50 %	0 %	25 %	25 %	427726367
45	NC_019685	TTG	2	6	3063	3068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726367
46	NC_019685	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726367
47	NC_019685	TGA	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726367
48	NC_019685	GCA	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726367
49	NC_019685	TGAGG	2	10	3222	3231	20 %	20 %	60 %	0 %	427726367
50	NC_019685	GAA	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726368
51	NC_019685	CCCA	2	8	3495	3502	25 %	0 %	0 %	75 %	427726368
52	NC_019685	AAC	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726368
53	NC_019685	TAA	2	6	3566	3571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726368
54	NC_019685	AGA	2	6	3608	3613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726368
55	NC_019685	GGA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427726368
56	NC_019685	CGA	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726369
57	NC_019685	CAC	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726369
58	NC_019685	CG	3	6	4140	4145	0 %	0 %	50 %	50 %	427726369
59	NC_019685	TTTG	2	8	4153	4160	0 %	75 %	25 %	0 %	427726369
60	NC_019685	AAC	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726369
61	NC_019685	ACC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726369
62	NC_019685	CCAG	2	8	4291	4298	25 %	0 %	25 %	50 %	427726369
63	NC_019685	CGG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726369
64	NC_019685	CCG	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427726369
65	NC_019685	CCG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427726370
66	NC_019685	TGC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726370
67	NC_019685	GTT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726370
68	NC_019685	AAT	2	6	5414	5419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726370
69	NC_019685	ATT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726370
70	NC_019685	TTGGC	2	10	5612	5621	0 %	40 %	40 %	20 %	427726370
71	NC_019685	GCT	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726370
72	NC_019685	GTC	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726370
73	NC_019685	CGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726370
74	NC_019685	AG	3	6	5801	5806	50 %	0 %	50 %	0 %	427726370
75	NC_019685	TTG	2	6	5905	5910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726370
76	NC_019685	TG	3	6	5918	5923	0 %	50 %	50 %	0 %	427726370
77	NC_019685	ACT	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726370
78	NC_019685	GCG	2	6	6073	6078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726370
79	NC_019685	T	8	8	6090	6097	0 %	100 %	0 %	0 %	427726370
80	NC_019685	TAC	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726370
81	NC_019685	GGCAAT	2	12	6158	6169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427726370
82	NC_019685	GT	3	6	6248	6253	0 %	50 %	50 %	0 %	427726370
83	NC_019685	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726370

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.